激光掃描共聚焦熒光顯微鏡是一種利用計算機、激光和圖像處理技術(shù)獲得生物樣品三維數(shù)據(jù)、目前較先進的分子細(xì)胞生物學(xué)的分析儀器。主要用于觀察活細(xì)胞結(jié)構(gòu)及特定分子、離子的生物學(xué)變化，定量分析，以及實時定量測定等。

　　激光共聚焦顯微鏡原理：利用放置在光 源后的照明針孔，和放置在檢測器前的探測針孔，實現(xiàn)點照明和點探測。來自光源的光通過照明針孔發(fā)射出的光聚焦在樣品焦平面的某個點上，該點所發(fā)射的熒光成像在探測針孔上，該點以外的任何發(fā)射光均被探測針孔阻擋。照明針孔與探測針孔對被照射點或被探測點來說是共軛的，因此被探測點即共焦點，被探測點所在的平面即共焦平面。

　　計算機以像點的方式將被探測點顯示在計算機屏幕上，為了產(chǎn)生一幅完整的圖像，由光路中的掃描系統(tǒng)在樣品焦平面上掃描，從而產(chǎn)生一幅完整的共焦圖像。只要載物臺沿著Z軸上下移動，將樣品新的一個層面移動到共焦平面上，樣品的新層面又成像在顯示器上，隨著Z軸的不斷移動，就可得到樣品不同層面連續(xù)的光切圖像。

　　與傳統(tǒng)光學(xué)顯微鏡的區(qū)別

　　傳統(tǒng)熒光顯微鏡有一個難以克服的缺點：焦平面以外的熒光結(jié)構(gòu)模糊、發(fā)虛。原因是大多數(shù)生物學(xué)標(biāo)本是重疊結(jié)構(gòu)，假若熒光標(biāo)記的結(jié)構(gòu)在不同層次上都有分布，且重疊，來自焦平面上方或下方的散射熒光也被物鏡所接收，熒光顯微鏡的分辨率就要大大降低。

　　在傳統(tǒng)光學(xué)顯微鏡基礎(chǔ)上，激光掃描共聚焦顯微鏡用激光作為光源，采用共軛聚焦原理和裝置，并利用計算機對所觀察的對象進行數(shù)字圖像處理觀察、分析和輸出。可以對樣品進行斷層掃描和成像，進行無損傷觀察和分析細(xì)胞的三維空間結(jié)構(gòu)。同時，利用免疫熒光標(biāo)記和離子熒光標(biāo)記探針，該技術(shù)不僅可觀察固定的細(xì)胞、組織切片,還可以對活細(xì)胞的結(jié)構(gòu)、分子、離子及生命活動進行實時動態(tài)觀察和檢測，在亞細(xì)胞水平上觀察諸如Ca2+，pH值，膜電位等生理信號及細(xì)胞形態(tài)的變化，成為形態(tài)學(xué)、分子細(xì)胞生物學(xué)、神經(jīng)科學(xué)、藥理學(xué)、遺傳學(xué)等領(lǐng)域中新一代強有力的研究工具。